| 축종별 | 지정기관 |
| 한우, 젖소, 육우, 토끼, 염소 | (사)한국종축개량협회 |
| 돼지 | (사)한국종축개량협회, (사)대한한돈협회 |
| 말(제주마 제외) | 한국마사회 |
| 제주마 | 제주특별자치도 축산진흥원 |
| 축종별 | 지정기관 |
| 한우 | ○ 농촌진흥청 국립축산과학원, 도 축산관련연구기관, 농협경제지주회사 가축개량원, (사)한국종축개량협회 |
| 젖소 | ○ 농촌진흥청 국립축산과학원, 도 축산관련연구기관, 농협경제지주회사 가축개량원, (사)한국종축개량협회 |
| 육우 | ○ 농촌진흥청 국립축산과학원 |
| 돼지 | ○ 농촌진흥청 국립축산과학원, 도 축산관련연구기관, (사)대한한돈협회, (사)한국종축개량협회 |
| 닭 | ○ 농촌진흥청 국립축산과학원, 도 축산관련연구기관, (사)대한양계협회 |
| 오리 | ○ 농촌진흥청 국립축산과학원, 도 축산관련연구기관, (사)한국오리협회 |
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